В соответствии с распоряжением Правительства Российской Федерации от 29.01.2015 № 111-р государственный природный заказник федерального значения «Томский» преобразован в заказник областного значения.
С целью включения заказника в региональную систему ООПТ в настоящее время ОГБУ «Облохотуправление» разрабатывает проект Положения о государственном зоологическом заказнике областного значения «Томский» и зонирования охраняемой территории с выделением разных функциональных зон.
4 февраля ОГБУ «Облохотуправление» организовано и проведено рабочее совещание по разработке проекта Положения и зонирования охраняемой территории совместно с Национальным исследовательским Томским государственным университетом, Департаментом охотничьего и рыбного хозяйства Томской области и Департаментом по культуре и туризму Томской области. От участников совещания поступили предложения о выделении различных функциональных зон.